Среднесписочная численность Института – 1130 человек, из них исследователей 520, инженерно-технических и других работников 610.

Распределение работников по региональным подразделениям: центральная часть (Москва) – 230 человек, подразделения в Троицке (Московская область) – 640, Баксанская нейтринная обсерватория (Северный Кавказ) – 245, Байкальская нейтринная обсерватория (оз.Байкал) – 8, Артёмовская научная станция (г.Соледар, Украина) – 7.

Научных сотрудников – 266 человек, в том числе 5 академиков, 3 члена-корреспондента РАН, 48 докторов наук и 166 кандидатов наук.

Среди них 5 профессоров, 4 заслуженных деятеля науки Российской Федерации, 4 лауреата Ленинских и 4 лауреата Государственных премий, 7 лауреатов премии Правительства РФ.

Наличие такого высококвалифицированного научного персонала позволяет Институту успешно решать на мировом уровне фундаментальные проблемы современной физики.

В аспирантуру ИЯИ РАН принимается 5-7 человек ежегодно. Большая часть окончивших аспирантуру остаётся работать в Институте.